基因組醫(yī)學(xué)研究院孫中生課題組

學(xué)校:溫州醫(yī)科大學(xué)

專業(yè):理學(xué)

年級:2018

招生人數(shù):4

招生狀態(tài):正在招生中

招生簡介：

溫州醫(yī)科大學(xué)基因組醫(yī)學(xué)研究院孫中生教授（院長）課題組基于國家發(fā)展戰(zhàn)略和十三五規(guī)劃（“腦科學(xué)與類腦研究”，“加速推進基因組學(xué)等生物技術(shù)大規(guī)模應(yīng)用”），主要利用基因組學(xué)、生物信息學(xué)、醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)、表觀遺傳學(xué)、分子生物學(xué)等研究手段從事復(fù)雜疾病、特別是神經(jīng)精神類疾病（例如，孤獨癥、智力低下）和癌癥的遺傳學(xué)機制研究。本課題組經(jīng)費充足，已經(jīng)申請到多個國家級課題，具有各種生物學(xué)實驗平臺、生物信息學(xué)分析平臺、具有良好的發(fā)展前景。科學(xué)研究上，本課題組在導(dǎo)師和學(xué)生的共同努力下，取得了多項突破性成功：

1、首次發(fā)現(xiàn)并報道節(jié)律基因PER1和PER2；

2、開發(fā)二代測序可視化工具MagicViewer和SplicingViewer，普通電腦可完成大數(shù)據(jù)可視化；

3、開發(fā)MicroRNA在線分析工具，被評為業(yè)內(nèi)最準確的工具之一；

4、通過全外顯子測序鑒定到中國第一個孤獨癥致病基因ANK3；

5、通過高通量測序鑒定肌萎縮側(cè)索硬化癥致病基因SOD1；

6、開發(fā)了第一款全面的在線的甲基化分析軟件RRBS-Analyser；

7、開發(fā)了癲癇相關(guān)突變與基因數(shù)據(jù)庫EpilepsyGene；

8、開發(fā)了第一款在線分析新生突變的工具mirTrios；

9、基于新生突變，首先系統(tǒng)分析神經(jīng)精神疾病的共有基因和通路，并開發(fā)NPdenovo數(shù)據(jù)庫；

10、開發(fā)低起始量，單精度的DNA甲基化圖譜的實驗與分析方法MBRidge；

11、開發(fā)單細胞DNA甲基化圖譜的實驗與分析方法Q-RRBS；

12、開發(fā)第一款RNA結(jié)合蛋白調(diào)控數(shù)據(jù)庫RBP-Var；

13、首次使用全基因組測序分析中國自閉癥患者突變圖譜；

14、首次鑒定到多個自閉癥新基因并進行了深入的分子機制研究；

15、開發(fā)相關(guān)致病基因信息的功能注釋平臺EpiDenovo；

16、開發(fā)節(jié)律表達和調(diào)控數(shù)據(jù)庫CirGRDB；

17、開發(fā)人類基因變異與臨床信息整合數(shù)據(jù)庫VarCards。

本課題組在Cell, Molecular Psychiatry, PNAS, Nucleic Acids Research, Journal of Molecular Cell Biology, Genetics in Medicine等國際權(quán)威雜志發(fā)表論文。

調(diào)劑名額：

生物信息學(xué)、基因組學(xué)等方向1-2名，遺傳學(xué)、分子生物學(xué)等方向1-2名，共計3-4名。

如有意向且符合條件者，請將簡歷發(fā)送至郵件zy_bioinformatics@163.com，我們會根據(jù)實際情況回復(fù)調(diào)劑生。

導(dǎo)師介紹：

孫中生教授簡介如下：

博士，研究員，博士生導(dǎo)師，中國遺傳學(xué)會表觀遺傳專業(yè)委員會主任, Hormones and Behavior雜志編委。1982年北京大學(xué)學(xué)士；1992年美國德克薩斯A&M大學(xué)博士；1993-1998年先后在德克薩斯大學(xué)安德生癌癥研究中心放射治療系、貝勒醫(yī)學(xué)院分子人類遺傳學(xué)系做博士后；1998-1999年任路易斯安那州立大學(xué)神經(jīng)科學(xué)中心助理教授、主任助理，同時任生物化學(xué)和遺傳系助理教授；1999-2005年在美國康奈爾大學(xué)任助理教授，威爾醫(yī)學(xué)院特護醫(yī)學(xué)實驗室主任；2005-2010年在中國科學(xué)院心理研究所行為遺傳學(xué)中心任研究員，2010年至今任北京生科院研究員。1997年,榮獲Science雜志十大科學(xué)突破，2006年入選中科院“百人計劃”，并入選“新世紀百千萬人才工程”。

學(xué)生待遇：

1、每月發(fā)放不低于1300元的生活補貼；

2、所有在讀研究生均享受8000－10000元/年的助學(xué)金，可抵消全部學(xué)費；

3、研究生期間，學(xué)生均有自己獨立負責(zé)的課題，同時參與、合作課題組其他相關(guān)課題；

應(yīng)聘要求：

1.本次招生重點面對生物信息學(xué)、基因組學(xué)、遺傳學(xué)、分子生物學(xué)等專業(yè)；

2.同時歡迎有醫(yī)學(xué)、計算機、數(shù)學(xué)背景的畢業(yè)生；

3.良好的英語閱讀寫作及聽說交流能力；

4.吃苦耐勞，有探索精神，對生命科學(xué)研究有濃厚興趣；

5.有計算機操作、編程基礎(chǔ)者或者相關(guān)生物實驗經(jīng)驗者優(yōu)先；

6.碩士畢業(yè)后有意向繼續(xù)深造者優(yōu)先；

7.符合溫州醫(yī)科大學(xué)碩士研究生招生調(diào)劑條件：http://yjsy.wmu.edu.cn/

學(xué)術(shù)成果：

2017年：

Liang J, Feng D, Cai W, Teng H, Mao F, Jiang Y, Hu S, Li X, Zhang Y, Liu B, Sun Z. Genetic landscape of papillary thyroid carcinoma in the Chinese population: Somatic mutational profile of PTC in China. Journal of Pathology. 2017, doi: 10.1002/path.5005. (IF= 6.894)

Mao F, Liu Q, Zhao X, Yang H, Guo S, Xiao L, Li X, Teng H, Sun Z, Dou Y. EpiDenovo: a platform for linking regulatory de novo mutations to developmental epigenetics and diseases. Nucleic Acids Res. 2017 Oct 10. doi: 10.1093/nar/gkx918. (IF= 10.162)

Li J, Shi L, Zhang K, Zhang Y, Hu S, Zhao T, Teng H, Li X, Jiang Y, Ji L, Sun Z. VarCards: an integrated genetic and clinical database for coding variants in the human genome. Nucleic Acids Res. 2017 Nov 3. doi: 10.1093/nar/gkx1039. (IF= 10.162)

Li X, Shi L, Zhang K, Wei W, Liu Q, Mao F, Li J, Cai W, Chen H, Teng H, Li J, Sun Z. CirGRDB: a database for the genome-wide deciphering circadian genes and regulators. Nucleic Acids Res. 2017 Oct 20. doi: 10.1093/nar/gkx944. (IF= 10.162)

Li J, Sun ZS, Xia K. Targeted sequencing and functional analysis reveal brain-size-related genes and their networks in autism spectrum disorders. Mol Psychiatry. 2017,22(9):1282-1290. (IF= 13.204)

Zhong JN, Li XF, Cai WS, Wang Y, Dong SS, Yang J, Zhang J, Wu NN, Li YY, Mao FB, Zeng C, Wu JY, Xu NZ, Sun ZS. TET1 modulates H4K16 acetylation by controlling auto-acetylation of hMOF to affect gene regulation and DNA repair function. Nucleic Acids Res. 2017,45(2):672-684. (IF= 10.162)

Wang J, Zhang K, Chen X, Liu X, Teng H, Zhao M, Sun Z. Epigenetic Activation of ASCT2 in the Hippocampus Contributes to Depression-Like Behavior by Regulating D-Serine in Mice. Front Mol Neurosci. 2017,10:139. doi: 10.3389/fnmol.2017.00139.eCollection. (IF= 5.076 )

Yan Wang, Huijie Liu, Zhongsheng Sun. Lamarck rises from his grave: parental environment-induced epigenetic inheritance in model organisms and humans. Biological Reviews , 2017. (IF= 11.615 )

Zhuang Miao, Fengbiao Mao, Moshe Szyf, Yan Wang, ZhongSheng Sun. Anxiety-Related Behaviours Associated with microRNA-206-3p and BDNF Expression in Pregnant Female Mice Following Psychological Social Stress.  Molecular Neurobiology, 2017.(IF=5.397)

2016年：

Jianing Zhong, Xianfeng Li, Wanshi Cai, Shanshan Dong, Jie Yang, Jian 'an Zhang, Nana Wu, Yuanyuan Li, Mao Fengbiao, Cheng Zeng, Jinyu Wu, Xingzhi Xu, Zhongsheng Sun.TET1 modulates H4K16 acetylation by controlling auto-acetylation of hMOF to affect gene regulation and DNA repair function. Nucleic Acids Research ,2016.(IF= 9.202)

Weiping Tian, Jiesi Wang, Ke Zhang, Huajing Teng, Chong Li, Moshe Szyf, Zhong Sheng Sun & Mei Zhao. Demethylation of c-MYB binding site mediates upregulation of Bdnf IV in cocaine-conditioned place preference OPEN. Scientific Reports, 2016. (IF=5.578)

Fengbiao Mao, Luoyuan Xiao, Xianfeng Li, Jialong Liang, Huajing Teng, Wanshi Cai, and Zhong Sheng Sun. RBP-Var: a database of functional variants involved in regulation mediated by RNA-binding proteins. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2016. (IF= 9.202)

2015年：

Li JC, Cai T, Jiang Y, Chen HQ, He X, Chen C, Li XF, Shao QZ, Ran X, Li ZS, Xia K, Liu CY, Sun ZS, Wu JY. Genes with de novo mutations are shared by four neuropsychiatric disorders discovered from NPdenovo database. Molecular Psychiatry, 2015. (IF=15.147)

Wanshi Cai , Fengbiao Mao , Huajing Teng, Tao Cai, Fangqing Zhao, Jinyu Wu and Zhong Sheng Sun. MBRidge An accurate and cost-effective method for profiling DNA methylome at single-base resolution. Journal of Moleucular Cell Biology, 2015. (IF=6.771)

Kangli Wanga, Xianfeng Libc, Shanshan Donga, Jialong Liangbd, Fengbiao Maobd, Cheng Zengb, Honghu Wua, Jinyu Wuab, Wanshi Caib & Zhong Sheng Sunab. Q-RRBS A quantitative reduced representation bisulfite sequencing method for single-cell methylome analyses. Epigenetics, 2015. (IF=4.780)

2014年：

Yan Wang, Guiling Li, Fengbiao Mao, Xianfeng Li, Qi Liu, Lin Chen, Lu Lv, Xin Wang, Jinyu Wu, Wei Dai, Guan Wang, Enfeng Zhao, Kai-Fu Tang and Zhong Sheng Sun. Ras-induced Epigenetic Inactivation of the RRAD Ras-related Associated with Diabetes Gene Promotes Glucose Uptake in a Human Ovarian Cancer Model. JURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 2014. (IF=4.573)

Qing Xie , Qi Liu , Fengbiao Mao, Wanshi Cai, Honghu Wu, Mingcong You, Zhen Wang, Bingyu Chen, Zhong Sheng Sun , Jinyu Wu . A Bayesian Framework to Identify Methylcytosines from High-Throughput Bisulfite Sequencing Data. PLOS Computational Biology, 2014. (IF=4.620)

Xia Ran, Jinchen Li, Qianzhi Shao, Huiqian Chen, Zhongdong Lin, Zhong Sheng Sun and Jinyu Wu. EpilepsyGene: a genetic resource for genes and mutations related to epilepsy. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2014. (IF=9.112)

溫州醫(yī)科大學(xué) 基因組醫(yī)學(xué)研究院

2018年 3 月 14 日