化學(xué)物理系是1958年中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)成立時(shí)，由著名科學(xué)家錢學(xué)森，郭永懷，柳大綱親自創(chuàng)辦的，旨在培養(yǎng)兼有化學(xué)和物理兩方面知識(shí)結(jié)構(gòu)的復(fù)合型人才，以適應(yīng)我國發(fā)展“兩彈一星”對于物理與化學(xué)相結(jié)合的交叉學(xué)科人才的需求。建系時(shí)設(shè)“高速化學(xué)反應(yīng)動(dòng)力學(xué)”和“物理力學(xué)”兩個(gè)專業(yè)。1964年中國科學(xué)技技術(shù)大學(xué)將四個(gè)與化學(xué)相關(guān)的系并為近代化學(xué)系， 1994年又恢復(fù)化學(xué)物理系的名稱。首任系主任是中國科學(xué)院力學(xué)所所長、中國科學(xué)院院士郭永懷先生。物理化學(xué)（含化學(xué)物理）專業(yè)于1981年獲碩士學(xué)位授予權(quán)，1993年獲博士學(xué)位授予權(quán)，2001年被教育部評定為國家重點(diǎn)學(xué)科，現(xiàn)設(shè)有博士后流動(dòng)站。
　　中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)化學(xué)物理系師資力量雄厚，現(xiàn)在崗教職工43人，其中中國科學(xué)院院士2人(朱清時(shí)院士和吳奇院士)，教授18人(博導(dǎo)18人)，教育部“長江學(xué)者”特聘教授1人，副教授(和其它副高職稱)14人。諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)獲得者李遠(yuǎn)哲教授和物理獎(jiǎng)獲得者K.Siegbahn教授應(yīng)聘擔(dān)任本系名譽(yù)教授，另聘國內(nèi)外院士和教授29人擔(dān)任我系客座/兼職教授。目前化學(xué)物理系的教師不僅大多數(shù)具有博士學(xué)位，而且大多都在國外大學(xué)工作或?qū)W習(xí)過，具有豐富的教學(xué)和科研經(jīng)驗(yàn)。
　　中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)化學(xué)物理系已成為國內(nèi)著名、國際知名的物理化學(xué)（含化學(xué)物理）科研基地和高級(jí)人才培養(yǎng)基地，現(xiàn)已本科畢業(yè)生1300余人，培養(yǎng)碩士和博士研究生500余人?；瘜W(xué)物理系本科設(shè)物理化學(xué)（含化學(xué)物理）專業(yè)，學(xué)制4年。本著“化學(xué)與物理相結(jié)合，宏觀與微觀相結(jié)合，基礎(chǔ)與應(yīng)用相結(jié)合” 的指導(dǎo)思想，堅(jiān)持站在化學(xué)物理的前沿，理論與實(shí)驗(yàn)工作緊密結(jié)合，注重化學(xué)與物理的交叉并向材料、生命科學(xué)滲透。培養(yǎng)的學(xué)生具有堅(jiān)實(shí)的數(shù)理化基礎(chǔ)、前沿的專業(yè)理論知識(shí)和化學(xué)實(shí)驗(yàn)技能。目前在校博士生80余人，碩士生80余人，本科生280余人，80%以上的本科畢業(yè)生被國內(nèi)外著名大學(xué)或研究機(jī)構(gòu)錄取為研究生，其余學(xué)生為各科研機(jī)構(gòu)或公司等聘用。
　　化學(xué)物理系的主要科研方向有單分子物理化學(xué)、原子分子光譜與化學(xué)動(dòng)力學(xué)、表面物理化學(xué)與催化化學(xué)、膠體與生物大分子物理化學(xué)以及理論與計(jì)算化學(xué)等，已取得了一系列創(chuàng)新性研究成果。目前承擔(dān)和參與國家重大科學(xué)研究計(jì)劃、國家973項(xiàng)目、中科院創(chuàng)新工程重點(diǎn)項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)和面上項(xiàng)目等50余項(xiàng)科研任務(wù)。