四川大學是全國首批建立生物工程專業(yè)的高等院校之一，該專業(yè)可以追溯到1985年創(chuàng)建的生物化工專業(yè)，于1986年開始招生，1990年開始培養(yǎng)研究生。1998年教育部進行專業(yè)調(diào)整，以生物化工專業(yè)為基礎(chǔ)發(fā)展成現(xiàn)在的生物工程專業(yè)。本專業(yè)長期以來秉承化工學科創(chuàng)始人張洪沅先生“立足基礎(chǔ)、面向工業(yè)、服務(wù)社會”的辦學理念，已逐步形成了“理工融合、創(chuàng)新驅(qū)動、實踐導(dǎo)向”的辦學特色。
生物工程專業(yè)長期以來堅持“以學生為中心”的人才培養(yǎng)核心理念，貫徹執(zhí)行四川大學“以人為本、崇尚學術(shù)、追求卓越”的現(xiàn)代大學辦學理念和“精英教育、質(zhì)量為本、科教結(jié)合、學科交叉”的人才培養(yǎng)指導(dǎo)思想，實施“分類指導(dǎo)、個性培養(yǎng)、注重創(chuàng)新、面向世界”的人才培養(yǎng)原則。數(shù)十年來，生物工程專業(yè)全體教師根據(jù)社會人才需求和專業(yè)發(fā)展狀況，不斷探索創(chuàng)新，優(yōu)化培養(yǎng)方案，堅持工程特色，重視實踐教學，發(fā)揮多學科交叉的優(yōu)勢，把培養(yǎng)應(yīng)用型工程技術(shù)人才作為培養(yǎng)目標。本專業(yè)培養(yǎng)的畢業(yè)生具有扎實的基礎(chǔ)知識和過硬的專業(yè)素質(zhì)，在工作中表現(xiàn)出了較強的創(chuàng)新精神和解決復(fù)雜工程問題的能力。每年畢業(yè)生供不應(yīng)求，畢業(yè)生入職用人單位后普遍受到好評。校友中涌現(xiàn)出大量的企業(yè)負責人和技術(shù)骨干。
四川大學生物工程學科屬于學校“雙一流”重點建設(shè)學科中的重要組成部分。生物工程學科從我國和四川省生物工程學科的實際出發(fā)，結(jié)合我校的優(yōu)勢，圍繞生物制造核心技術(shù)體系，依托化學工程與技術(shù)國家一級學科以及國家生物科學與技術(shù)人才基地、國家工科基礎(chǔ)課程化學教學基地、制藥工程與技術(shù)四川省重點實驗室，注重各學科的交叉融合，逐漸形成了工業(yè)和環(huán)境微生物技術(shù)、生物資源和能源、生物分離材料與方法、生物礦化、生物制藥、天然產(chǎn)物化學和生物醫(yī)用材料等特色鮮明的研究方向。
歷經(jīng)30余年，生物工程專業(yè)在學校和學院的大力支持下有了長足的發(fā)展，已建設(shè)成同時具有生物工程學士、生物化工碩士和博士學位授予權(quán)、博士后流動站以及工程博士、工程碩士授予權(quán)，已經(jīng)逐步發(fā)展成為我國和四川省生物工程領(lǐng)域的重要科學研究和人才培養(yǎng)基地。
培養(yǎng)目標：培養(yǎng)適應(yīng)現(xiàn)代生物工程技術(shù)發(fā)展和經(jīng)濟及社會發(fā)展需要的人才。學生應(yīng)掌握生物工程及其產(chǎn)業(yè)化的科學原理、工藝技術(shù)、工藝和工程設(shè)計等基礎(chǔ)理論和技能，并具有良好的人文社會科學素養(yǎng)、創(chuàng)新意識及國際化視野，能在生物技術(shù)與工程及相關(guān)領(lǐng)域從事技術(shù)與產(chǎn)品研發(fā)、生產(chǎn)與技術(shù)管理、質(zhì)量管理與控制、工藝與工程設(shè)計、經(jīng)營管理等工作，成為所從事領(lǐng)域的專業(yè)技術(shù)和管理工作的中高級骨干。
主干課程：計算機基礎(chǔ)、物理化學、化工原理、生物化學、微生物學、基因工程、發(fā)酵工程、細胞工程、蛋白質(zhì)工程、生物反應(yīng)工程、生物分離工程、生物工藝學、生物工程設(shè)備、生物工程設(shè)計等。