5. 課題組近年代表性論文
1)     Jia Yang, Qi Yang, Menghua Cai, Chao Li, Fei Gao, Huaishan Wang, Dongdong Wang, Yi Fu, Yu Zhou, Hui Chen, Yu Hu, Xuan Zhang, Wei He*, Jianmin Zhang*. ATPase Thorase Regulates Mitochondrial Quality Control and Pathogenesis of Neurodegenerative Diseases. (Under revision on Neuron)
2)     Huaishan Wang, Fei Gao, Jia Yang, Yi Fu, Yingchao Xue, Qi Yang, Menghua Cai, Xue Zhang, Yu Zhou, Kangle Zhai, Yu Hu, Hui Chen, Fang Liu, Yi Xu, Chao Ma, Wei He* and Jianmin Zhang*. TSPO/PBR Knockout Promotes Amyloid Pathology and Neuroinflammation by Affecting Microglia Phagocytosis. (Under revision on Neurobiology of ageing)
3)    Yi Fu, Dongdong Wang, Huaishan Wang, Junwen Zhang, Hui Chen, Yu Hu, Xuan Zhang, Mingyao Ying, Wei He*, Jianmin Zhang^*. TSPO deficiency induces mitochondrial dysfunction, leading to hypoxia, angiogenesis and a growth-promoting metabolic shift towards glycolysis in glioblastoma. Neuro Oncol. 2019 Sep 29. pii: noz183. doi: 10.1093/neuonc/noz183.
4)    Yuxia Li, Xinfeng Wang, Da Teng, Hui Chen, Maoshui Wang, Junjing Wang, Jianmin Zhang^*, Wei He.Identification of the Ligands of TCRγδ by Screening the Immune Repertoire of γδT Cells from Patients with Tuberculosis. Front. Immunol., 24 September 2019 https://doi.org/10.3389/fimmu.2019.02282
5)     Menghua Cai, Yan Zhu, Zinan Li, Yu Zhou, Yu Hu, Hui Chen, Yun Liu *, Wei He * and Jianmin Zhang*. Profiling the Gene Expression and DNA Methylation in the Mouse Brain after Ischemic Preconditioning. Neuroscience. 406 (2019) 249–261
6)     Fei Gao, Jianmin Zhang *. Mitochondrial quality control and neurodegenerative diseases. Neuronal Signalling. (2018) https://doi.org/10.1042/NS20180062
7)     Yingchao Xue, Xiping Zhan, Shisheng Sun, Senthilkumar S. Karuppagounder, Shuli Xia, Valina L. Dawson, Ted M. Dawson, John Laterra, Jianmin Zhang* and Mingyao Ying*. Synthetic mRNAs drive highly efficient iPSC cell differentiation into dopaminergic neurons. Stem Cell Translational Medicine. 2018 Nov 1. doi: 10.1002/sctm.18-0036
8)     Peng Dong, Xiangwu Ju, Yiwu Yan, Siya Zhang, Menghua Cai, Huaishan Wang, Hui Chen, Yu Hu, Lianxian Cui, Jianmin Zhang*, Wei He*. γδ T cells provide protective function in highly pathogenic avian H5N1 influenza A virus infection. 2018 Dec 4;9:2812. doi: 10.3389/fimmu.2018.02812. eCollection 2018..
9)     Xue Zhang, Fei Gao, Dongdong Wang, Chao Li, Yi Fu, Wei He^*, Jianmin Zhang^*. Tau pathology in Parkinson’s disease. Front. Neurol., October 2, 2018; https://doi.org/10.3389/fneur.2018.00809
10)   Jianmin Zhang, Jia Yang, Huaishan Wang, Omar Sherbini, Matthew J. Keuss, George K. E. Umanah, Emily Ling-Lin Pai , Zhikai Chi, Kaisa M. A. Paldanius, Wei He, Hong Wang, Shaida A. Andrabi, Ted M. Dawson, and Valina L. Dawson The AAA + ATPase Thorase is neuroprotective against ischemic injury. J Cereb Blood Flow Metab. 2018 Jan 1:271678X18769770. doi: 10.1177/0271678X18769770
11)   Zinan Li, Siya Zhang, Ying Wan, Weiqing Wang, Yuli Zhu, Zhen Li, Yu Hu, Huaishan Wang, Hui Chen, Lianxian Cui, Xuan Zhang, Jianmin Zhang*, Wei He*. miR-146a Regulates the Positive Selection During T Cell Development. Front Immunol. 2018 Jan 23;8:2006. doi: 10.3389/fimmu.2017.02006
12)   Yuli Zhu, Siya Zhang, Zinan Li, Huaishan Wang, Zhen Li, Yu Hu, Hui Chen, Xuan Zhang, Lianxian Cui, Denian Ba, Jianmin Zhang*, Wei He*. MiR-125b-5p and miR-99a-5p regulate the activation and cytotoxicity of gd T cells. Cell Mol Immunol. 2018 Feb 12. doi: 10.1038/cmi.2017.164
13)   Hui Chen, Mingjin Zou, Da Teng, Yu Hu, Jianmin Zhang*, Wei He¹*. Profiling the pattern of the human T cell receptor γδ complementary determinant region 3 repertoire in patients with lung carcinoma. Cell Mol Immunol. 2018 Feb 5. doi: 10.1038/cmi.2017.157
14)   Fei Gao, Jia Yang, Chao Li, Huaishan Wang, Wei He^*, Jianmin Zhang^*. Mitophagy in Parkinson Disease: Pathogenic Roles and Therapeutic Implications. Front. Neurol., 2017; doi.org/10.3389/fneur.2017.00527
15)   Wen-Xiu Mo, Shan-Shan Yin, Hua Chen, Chen Zhou, Jia-Xin Zhou, Li-Dan Zhao, Yun-Yun Fei, Hua-Xia Yang, Jing-Bo Gou, Yu-Jia Mao, Lin-Fang Huang, Wen-Jie Zheng, Wen Zhang, Jian-Min Zhang, Wei He*, Xuan Zhang*. Chemotaxis of Vδ2 T cells to the joints contributes to the pathogenesis of Rheumatoid Arthritis. Ann Rheum Dis. 2017 Dec;76(12):2075-2084. doi: 10.1136/annrheumdis-2016-211069
16)   Chen H, Zou M, Teng D, Zhang J*, He W. Characterization of the diversity of T cell receptor γδ complementary determinant region 3 in human peripheral blood by Immune Repertoire Sequencing. J Immunol Methods. 2017 Jan 31. pii: S0022-1759(16)30291-5. doi: 10.1016/j.jim.2017.01.009.
17)   Wang H, Zhai K, Xue Y, Yang J, Yang Q, Fu Y, Hu Y, Liu F, Wang W, Cui L, Chen H, Zhang J*, He W*. Global Deletion of TSPO Does Not Affect the Viability and Gene Expression Profile. PLoS One. 2016 Dec 1;11(12):e0167307. doi: 10.1371/journal.pone.0167307
18)   Jianmin Zhang, Huaishan Wang, Omar Sherbini, Emily Ling-lin Pai, Sung-Ung Kang, Ji-Sun Kwon, Jia Yang, Wei He, Hong Wang, Stephen M. Eacker, Zhikai Chi, Xiaobo Mao, Jinchong Xu, Haisong Jiang, Shaida A. Andrabi, Ted M. Dawson, Valina L. Dawson. High Content Genome-Wide RNAi Screen Reveals CCR3 as a Key Mediator of Neuronal Cell Death. eNEURO. 2016 Oct 7. DOI: 10.1523/ENEURO.0185-16.2016
6. 課題組近5年專利
1)      γδT淋巴細(xì)胞中δ1鏈互補決定域3的優(yōu)勢序列及其TCR受體轉(zhuǎn)染細(xì)胞與應(yīng)用。授權(quán)公告日：2014.07.09；專利號：ZL 2011 1 0126369.3。
2)      基因修飾CDR3δ移植型γδT淋巴細(xì)胞及其抑癌用途。授權(quán)公告日：2014.08.13；專利號：ZL 2010 1 0518490.6。
3)      抗人γδTCR單克隆抗體的重組單鏈抗體G5-4ScFv及其編碼基因與應(yīng)用。專利申請日：2011.11.30；授權(quán)公告日：2017.04.12。專利號/申請?zhí)枺?01110139150.3。
4)      腫瘤結(jié)合特異性gdTCR基因修飾的αβT細(xì)胞及其抑癌用途。專利申請日：2015.11.26；授權(quán)公告日：2018.10.09；專利號/申請?zhí)枺?01510846740.1。
5)      一種檢測過敏原的新型蛋白質(zhì)芯片。專利申請日：2017.04.28;申請?zhí)?201710293500.2. （正在審理中）

二、曹雪濤課題組
1. 課題組簡介
        課題組主要從事天然免疫識別與炎癥疾病的基礎(chǔ)研究、腫瘤等疾病的免疫治療的應(yīng)用研究。
2. 課題組負(fù)責(zé)人介紹
        曹雪濤，中國工程院院士，現(xiàn)任中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院院長、北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院校長、醫(yī)學(xué)免疫學(xué)國家重點實驗室主任。德國科學(xué)院院士、法國醫(yī)學(xué)科學(xué)院院士、英國醫(yī)學(xué)科學(xué)院院士、美國醫(yī)學(xué)科學(xué)院院士、亞洲大洋洲免疫學(xué)聯(lián)盟秘書長、中國免疫學(xué)會秘書長、中國醫(yī)學(xué)工程學(xué)會理事長、中國科協(xié)生命科學(xué)聯(lián)合體主席。
        主要從事天然免疫與炎癥的基礎(chǔ)研究和腫瘤免疫治療轉(zhuǎn)化應(yīng)用研究。發(fā)現(xiàn)和鑒定了數(shù)種新型免疫細(xì)胞亞群和新型免疫分子，揭示天然免疫識別與應(yīng)答調(diào)控新分子機制、提出免疫炎癥消退新觀點。提出腫瘤免疫逃逸的新途徑，鑒定了預(yù)測腫瘤轉(zhuǎn)移與患者預(yù)后的標(biāo)志物分子，研制的樹突狀細(xì)胞疫苗臨床試治晚期腫瘤患者完成了II期臨床試驗并獲得CFDA批文開展III期臨床試驗。
        以通訊作者發(fā)表SCI收錄論文230余篇，其中包括Nature、Cell、Science、Nature Immunology、Cancer Cell、Immunity等。論文SCI他引10000多次。獲得國家發(fā)明專利16項、國家II類新藥證書2個。創(chuàng)辦《中國腫瘤生物治療雜志》并任主編，Cellular and Molecular Immunology共同主編,J Mol Med和Cancer Immunology Research 副主編、任Cell、Annual Reviews of Immunology、Science Translational Medicine、eLife、Cell Research等雜志編委。研究成果曾獲得2003年度國家自然科學(xué)獎二等獎；研究成果曾入選中國十大科技進(jìn)展（2011）以及中國高等學(xué)校十大科技進(jìn)展（五次，2000/2004/2009/2014/2015）。先后獲得全國十大杰出青年（2000）、中國青年科學(xué)家獎、何梁何利科學(xué)與技術(shù)進(jìn)步獎、談家楨生命科學(xué)成就獎、首屆樹森蘭娟人才基金“樹蘭醫(yī)學(xué)獎”、2013年中國工程院光華工程科技獎、2016年中國科學(xué)院陳嘉庚科學(xué)獎等。培養(yǎng)的博士生有12名獲得全國百篇優(yōu)秀博士學(xué)位論文，獲2014年首屆中國研究生教育特等獎、2015年《Nature》導(dǎo)師成就獎。
3. 課題組成員介紹
組內(nèi)人員：
姜明紅 博士 副研究員，碩士生導(dǎo)師 jiangminghong@163.com    69156966
王春梅 博士 副研究員，碩士生導(dǎo)師 wangcm1977@126.com   69156966
許小青 博士 助理研究員 xxqdata@163.com    65281907
王冰晶 博士助理研究員   winter_wbj@hotmail.com   69156966
劉音   主管技師  liuyinbj@sina.com  69156966
4. 課題組主要科研項目

5. 課題組近5年代表性論文
1.  Shuo Liu, Minghong Jiang, Wendie Wang, Wei Liu, Xiaoqi Song, Zhongfei Ma, Shikun Zhang, Lun Liu, Yin Liu, Xuetao Cao. Nuclear RNF2 inhibits interferon function by promoting K33-linkage of STAT1 disassociation from DNA. Nat Immunol.2018 Jan;19:41-52.
2.  Zheng Q, Hou J, Zhou Y, Li Z, Cao X. The RNA helicase DDX46 inhibits innate immunity by entrapping m6A-demethylated antiviral transcripts in the nucleus. Nat Immunol. 2017 Oct;18(10):1094-1103.
3.  Xia M, Liu J, Liu S, Chen K, Lin H, Jiang M, Xu X, Xue Y, Liu W, Gu Y, Zhang X, Li Z, Yi L, Qian Y, Zhou C, Li R, Zhang X, Li Z, Cao X. Ash1l and lnc-Smad3 coordinate Smad3 locus accessibility to modulate iTreg polarization and T cell autoimmunity. Nature communications, 2017 Jun 9;8:15818. 
4.  Chunmei Wang, Qinlan Wang, Xiaoqing Xu, Bin Xie, Yong Zhao, Nan Li, XuetaoCao.The methyltransferase NSD3 promotes antiviral innate immunity via direct lysine methylation of IRF3. J EXP MED. 2017. Vol. 214 No. 12 3597–3610
5.  Jia Xu, Xiaoqing Xu, Bingjing Wang, Yuanwu Ma, Lianfeng Zhang, Henan Xu, Ye Hu, Jiacheng Wu, and Xuetao Cao. Nuclear carbonic anhydrase 6B associates with PRMT5 to epigenetically promote IL-12 expression in innate response. PNAS, 2017,114(32):8620-8625.
6.  Chunyuan Zhao,  MutianJia, Hui Song, Zhongxia Yu, Wenwen Wang, Qi Li, Lining Zhang, Wei Zhao,  Xuetao Cao. The E3 ubiquitin ligase TRIM40 attenuates antiviral immune responses by targetingMDA5 and RIG-I.Cell report.2017. 21.6.1613-1623
7.  Li X, Zhang Q, Shi Q, Liu Y, Zhao K, Shen Q, Shi Y, Liu X, Wang C, Li N, Ma Y, Cao X. Demethylase Kdm6a epigenetically promotes IL-6 and IFN-β production in macrophages. Journal of Autoimmunity. 2017,Jun;80:85-94.
8.  Wendie Wang, Minghong Jiang, Shuo Liu, Shikun Zhang, Wei Liu, Yuanwu Ma, Lianfeng Zhang, Jiyan Zhang, and Xuetao Cao. RNF122 suppresses antiviral type I interferon production by targeting RIG-I CARDs to mediate RIG-I degradation.  PNAS, 2016, Aug. 113 (34)9581–9586
9.  Qian Zhang, Kai Zhao, Qicong Shen, Yanmei Han, Yan Gu, Xia Li, Dezhi Zhao, Yiqi Liu, ChunmeiWang,Xiang Zhang, Xiaoping Su, Juan Liu, Wei Ge, Ross L. Levine, Nan Li &Xuetao Cao.  Tet2 is required to resolve inflammation by recruiting Hdac2 to specifically repress IL-6 Nature2015 Sep 17;525(7569):389-93
10.  Mingjin Yang, Taoyong Chen, Xuelian Li, Zhou Yu, Songqing Tang, Chen Wang, Yan Gu, Yanfang Liu, Sheng Xu, Weihua Li, Xuemin Zhang, Jianli Wang&Xuetao Cao.  K33-linked polyubiquitination of Zap70 by Nrdp1 controls  CD8+ T cell activationNature immunology 2015 Dec.16(12) 1253-1264
6. 課題組近5年專利

三、黃波課題組
1. 課題組簡介
        實驗室主要研究腫瘤免疫，腫瘤生物治療，生物機械力，腫瘤休眠，腫瘤代謝等前沿醫(yī)學(xué)科學(xué)問題。在Cancer cell、Nature Materials、Nature Cell Biology、Nature Communications、Journal of Clinical Investigation、Blood、Cell Research、Leukemia、EMBO Reports、Cancer Immunology Research、Cancer Research、Oncogene、Biomaterials、Journal of Immunology等一系列主流雜志上發(fā)表50多篇研究論文，被SCI引用3000多次。實驗室目前有副教授/副研究員1名，在站博士后2名，博士研究生10名，碩士研究生3名。
        研究方向：
（1）腫瘤休眠：探討化學(xué)因素（IFN-gamma/IFN-beta等）和物理因素（生物機械力）誘導(dǎo)腫瘤休眠機制，探尋打破腫瘤休眠、誘導(dǎo)腫瘤休眠細(xì)胞進(jìn)入凋亡的治療方法；
（2）腫瘤代謝：分析腫瘤細(xì)胞、腫瘤干細(xì)胞、腫瘤相關(guān)免疫細(xì)胞的特殊代謝方式，發(fā)現(xiàn)以代謝為基礎(chǔ)的腫瘤治療靶點；
（3）腫瘤生物治療：以腫瘤細(xì)胞來源的微顆粒為載體，攜帶化療藥物、溶瘤病毒等對腫瘤進(jìn)行治療；對微顆粒的化療增敏效應(yīng)或者作為新型口服疫苗進(jìn)行研究；微顆粒治療膽管癌及惡性腫瘤患者胸腹水的臨床前機制研究；
（4）腫瘤生物機械力：運用生物力學(xué)篩選腫瘤干細(xì)胞，對腫瘤發(fā)生發(fā)展進(jìn)行研究以及探尋腫瘤治療新思路新靶點；探究生物力學(xué)信號對細(xì)胞增殖、分化的影響，揭示生物力學(xué)信號在T細(xì)胞對腫瘤干細(xì)胞殺傷過程中的作用；
（5）干細(xì)胞體外培養(yǎng)及擴(kuò)增：利用3D纖維蛋白軟膠體外擴(kuò)增造血干細(xì)胞，為臨床免疫治療尋找新的途徑及方法。
 
2. 課題組負(fù)責(zé)人介紹
        黃波，協(xié)和學(xué)者特聘教授、博士生導(dǎo)師，國家杰出青年基金，獲國家百千萬人才，國家有突出貢獻(xiàn)的中青年專家稱號，科技部中青年科技創(chuàng)新領(lǐng)軍人才，入選國家萬人計劃。
        現(xiàn)任中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所副所長、免疫學(xué)系常務(wù)副主任，并兼任中國免疫學(xué)會副秘書長與常務(wù)理事、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院青年創(chuàng)新聯(lián)盟理事長、國際免疫學(xué)會聯(lián)盟（IUIS）教育委員會委員、中國免疫學(xué)會腫瘤免疫與腫瘤生物治療專業(yè)委員會主任委員、中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)會理事、中國抗癌協(xié)會腫瘤生物治療專業(yè)委員會秘書長，擔(dān)任European Journal of Immunology 、Cellular and Molecular Immunology、Cancer Letters、Immunology Letters雜志編委。
        主要研究集中在腫瘤免疫生物學(xué)、腫瘤免疫和生物治療，完全自主研究的低劑量環(huán)磷酰胺治療尖銳濕疣和腫瘤囊泡治療腫瘤技術(shù)分別已用于臨床以及進(jìn)入臨床試驗階段。
 
3. 課題組成員介紹
劉玉英，副研究員，博士，13161773902@163.com, 69156450
付佳霖，助理研究員，博士，fjl1988@126.com, 69156464
解靜，博士后，xhxiejing@163.com, 69156450
Roland Fiskesund, 博士后，rolandfiskisund@ki.se, 69156464
 
4. 課題組主要科研項目
（1）國自然科學(xué)中心項目，天然免疫細(xì)胞活化和死亡機制及其炎性疾病， 2018-2023，子課題負(fù)責(zé)人：黃波；
（2）國自然國際合作與交流項目，基于多角度篩選及聯(lián)合生物標(biāo)志的黑色素瘤及肺癌新免疫療法， 2016-2019，項目負(fù)責(zé)人：黃波；
（3）國自然重點項目，腫瘤微顆粒介導(dǎo)M2型腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞（TAM）生成的機制與基于微顆粒靶向TAM的治療基礎(chǔ)研究， 2016-2020，項目負(fù)責(zé)人：黃波；
（4）國自然面上項目，腫瘤細(xì)胞來源的微顆粒介導(dǎo)卵巢癌的免疫治療與化療， 2015-2018，項目負(fù)責(zé)人：黃波；
（5）國家杰出青年科學(xué)基金，腫瘤免疫，2013-2016，項目負(fù)責(zé)人：黃波；
（6）973課題，逆轉(zhuǎn)免疫抑制和打破免疫耐受，重激活抗腫瘤應(yīng)答的腫瘤免疫治療新途徑的研究，2014-2019，子課題負(fù)責(zé)人：黃波；
（7）中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)健康與科技創(chuàng)新工程項目，免疫治療及新型生物治療， 2016-2020，項目首席：黃波；
（8）國自然面上項目，IFN-β激活I(lǐng)DO1-Kyn-AhR信號通路調(diào)節(jié)腫瘤再生細(xì)胞休眠， 2018-2021，項目負(fù)責(zé)人：劉玉英
 
5. 課題組近5年代表性論文
(1) Liu Y, Liang X, Dong W, Lv J, Fiskesund R, Xie J, Jin X, Degao Chen, Mo S, Zhang T, Cheng F, Zhou Y, Zhang H, Wang J, Hu Z, Cao X, Qin F, Huang B*. Tumor-repopulating cells transfer kynurenine to upregulate PD-1 expression in tumor-specific CD8+ T cells through AhR activation. Cancer Cell.Accepted.
(2) Liu Y, Lv J, Liu J, Liang X, Jin X, Xie J, Chen D, Fiskesund R, Dong W, Mo S, Zhang T, Cheng F, Zhou Y, Zhang H, Hu Z, Cao X, Qin F, Huang B*. J Clin Invest. Accepted.
(3)Ma R, Ji T, Zhang H, Dong W, Chen X, Xu P, Chen D, Ma J, Tang K, Zhang Y, Peng Y, Lu J, Zhang Y, Qin X, Cao X, Wan Y, Huang B*. A Pck1-directed glycogen 1 metabolic program regulates formation and maintenance of memory CD8+ T cells.Nat Cell Biol. 2018; 20:21-27.
(4) Liu Y, Liang X, Yin X, Lv J, Tang K, Ma J, Ji T, Zhang H, Dong W, Jin J, Chen D, Li Y, Zhang S, Xie H, Zhao B, Zhao T, Lu J, Hu Z, Cao X, Qin X, Huang Bo*. Blockade of IDO-kynurenine-AhR metabolic circuitry abrogates IFN-γ-induced immunologic dormancy of tumor-repopulating cells. Nat Commun. 2017; 8:15207.
(5) Luo S, Li Y, Ma R, Liu J, Xu P, Zhang H, Tang K, Ma J, Liu N, Zhang Y, Sun Y, Ji T, Liang X, Yin X, Liu Y, Tong W, Niu Y, Wang N, Wang X,Huang Bo*. Downregulation of PCK2 remodels tricarboxylic acid cycle in tumor-repopulating cells of melanoma. Oncogene.2017; 36:3609-3617.
(6) Sun Y, Zheng Z, Zhang H, Yu Y, Ma J, Tang K, Xu P, Ji T, Liang X, Chen D, Jin X, Zhang T, Long Z, Liu Y, Huang Bo*. Chemotherapeutic tumor microparticles combining low dose irradiation reprogram tumor-promoting macrophages through a tumor-repopulating cell-curtailing pathway. Oncoimmunology. 2017; 6(6):e1309487.
(7) Dong W, Zhang H, Yin X, Liu Y, Chen D, Liang X, Jin X, Lv J, Ma J, Tang K, Hu Z, Qin X, Huang Bo*. Oral delivery of tumor microparticle vaccines activates NOD2 signaling pathway in ileac epithelium rendering potent antitumor T cell immunity. OncoImmunology. 2017; 6(3):e1282589.
(8) Jin X, Ma J, Liang X, Tang K, Liu Y, Yin X, Zhang Y, Zhang H, Xu P, Chen D, Zhang T, Lu J, Hu Z, Qin X, Zeng X, Li L, Huang Bo*. Pre-instillation of tumor microparticles enhances intravesical chemotherapy of nonmuscle-invasive bladder cancer through a lysosomal pathway. Biomaterials. 2017; 113:93-104.
(9) Ma J, Zhang Y, Tang K, Zhang H, Yin X, Li Y, Xu P, Sun Y, Ma R, Ji T, Chen J, Zhang S, Zhang T, Luo S, Jin Y, Luo X, Li C, Gong H, Long Z, Lu J, Hu Z, Cao X, Wang N, Yang X, Huang B*. Reversing drug resistance of soft tumor-repopulating cells by tumor cell-derived chemotherapeutic microparticles. Cell Res. 2016;26:713-27.
(10) Ran L, Tan X, Li Y, Zhang H, Ma R, Ji T, Dong W, Tong T, Liu Y, Chen D, Yin X, Liang X, Tang K, Ma J, Zhang Y, Cao X, Hu Z, Qin X, Huang Bo* . Delivery of oncolytic adenovirus into the nucleus of tumorigenic cells by tumor microparticles for virotherapy. Biomaterials. 2016; 89:56-66.
(11) Ma R, Ji T, Chen D, Dong W, Zhang H, Yin X, Ma J, Liang X, Zhang Y, Shen G, Qin X, Huang Bo*. Tumor cell-derived microparticles polarize M2 tumor-associated macrophages for tumor progression. Oncoimmunology. 2016; 5(4):e1118599.
(12) Tang K, Hu L, Ma J, Zhang H, Zhang Y, Li Y, Ma R, Luo S, Liu D, Long G, Han M, Liu S, Song A, Shen M, Hu G, Huang Bo*. Brief Report: Human Mesenchymal Stem-Like Cells Facilitate Floating Tumorigenic Cell Growth via Glutamine-Ammonium Cycle. Stem Cells.2015; 33:2877-84.
(13) Wang Z, Cheng Q, Tang K, Sun Y, Zhang K, Zhang Y, Luo S, Zhang H, Ye D, Huang Bo*. Lipid mediator lipoxin A4 inhibits tumor growth by targeting IL-10-producing regulatory B (Breg) cells. Cancer Lett.2015; 364:118-24.
(14) Zhang H & Huang Bo*. Tumor cell-derived microparticles: a new form of cancer vaccine. Oncoimmunology. 2015; 4:e1017704.
(15) Li Y, Luo S, Ma R, Liu J, Xu P, Zhang H, Tang K, Ma J, Zhang Y, Liang X, Sun Y, Ji T, Wang N, Huang Bo*. Upregulation of cytosolic phosphoenolpyruvate carboxykinase is a critical metabolic event in melanoma cells that repopulate tumors. Cancer Res. 2015; 75:1191-6.
(16) Zhang H, Tang K, Zhang Y, Ma R, Ma J, Li Y, Luo S, Liang X, Ji T, Gu Z, Lu J, He W, Cao X, Wan Y, Huang Bo*. Cell-free tumor microparticle vaccines stimulate dendritic cells via cGAS/STING signaling. Cancer Immunol Res. 2015; 3:196-205.
(17) Ma R, Zhang W, Tang K, Zhang H, Zhang Y, Li D, Li Y, Xu P, Luo S, Cai W, Ji T, Katirai F, Ye D, Huang Bo*. Switch of glycolysis to gluconeogenesis by dexamethasone for treatment of hepatocarcinoma. Nat Commun. 2013; 4:2508.
(18) Liu J, Tan Y, Zhang H, Zhang Y, Xu P, Chen J, Poh YC, Tang K, Wang N, Huang Bo*. Soft fibrin gels promote selection and growth of tumorigenic cells. Nat Mater. 2012; 11:734-41.
(19) Tang K, Zhang Y, Zhang H, Xu P, Liu J, Ma J, Lv M, Li D, Katirai F, Shen GX, Zhang G, Feng ZH, Ye D, Huang Bo*. Delivery of chemotherapeutic drugs in tumour cell-derived microparticles. Nat Commun. 2012; 3:1282.
(20) Lv M, Zhang X, Jia H, Li D, Zhang B, Zhang H, Hong M, Jiang T, Jiang Q, Lu J, Huang X, Huang Bo*. An oncogenic role of miR-142-3p in human T cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) by targeting glucocorticoid receptor alpha and cAMP/PKA pathways. Leukemia.2012; 26:769-777.
 
6. 課題組近5年專利
        一種腫瘤化療藥物制劑及其制備方法，ZL201110241369.8，專利權(quán)人：黃波；湖北盛齊安生物科技有限公司
 
四、羅云萍課題組
1. 課題組簡介
        本課題組研究方向集中在腫瘤微環(huán)境中的免疫細(xì)胞與腫瘤細(xì)胞的相互作用以及與腫瘤發(fā)生，浸潤和轉(zhuǎn)移的關(guān)系。研究腫瘤干細(xì)胞與腫瘤微環(huán)境的相互關(guān)系，篩選實體腫瘤干細(xì)胞中潛在、特異性的生物分子標(biāo)志，深人分析與研究這些分子標(biāo)志以及它們的生物學(xué)功能，探尋其作為腫瘤治療靶點的潛力。
 
2. 課題組負(fù)責(zé)人介紹
        羅云萍，高級職稱，博士，yunpingluo@126.com 電話：010-69156475
        羅云萍教授是基礎(chǔ)所特聘教授，長期致力于腫瘤微環(huán)境與腫瘤干細(xì)胞的研究工作，課題組主要圍繞腫瘤微環(huán)境中大量存在的腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞，從轉(zhuǎn)錄組、代謝組和表觀調(diào)控等角度分別深入研究腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞的功能重塑機制及其在促進(jìn)腫瘤生長和轉(zhuǎn)移中作用。研究結(jié)果在Journal of Clinical Investigation，Cancer Research, Oncogene, Stem Cells, PNAS等高水平的雜志上發(fā)表。
 
3. 課題組成員介紹
        陳翀，中級職稱，博士，chenchongxyp86@163.com 電話：010-65284024
        段昭君，中級職稱，博士，jun-0512@163.com 電話：010-65284024
 
4. 課題組主要科研項目
(1) 國家自然科學(xué)基金面上項目，81672914，腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞分泌Exosome包裹的microRNA對腫瘤細(xì)胞干性特性的調(diào)控機制的研究，起始時間：2017/01-2020/12，資助金額：60萬元，在研中，主持。
(2) 國家自然科學(xué)基金面上項目，81472654，分泌型microRNA調(diào)控巨噬細(xì)胞表型機制及其作為診斷標(biāo)記物可行性探索，起始時間：2015/01-2018/12，資助金額：72萬元，在研中，主持。
(3) 科技部重大科學(xué)研究計劃，2013CB967200，腫瘤干細(xì)胞在實體腫瘤發(fā)展中的調(diào)控機制研究，起始時間：2013/01-2017/12，資助金額：568萬元，在研中，課題主持。
(4) 國家自然科學(xué)基金重大研究計劃，91029734，非可控性炎性微環(huán)境對腫瘤干細(xì)胞轉(zhuǎn)錄網(wǎng)絡(luò)機制的調(diào)控及其新的治療策略的探索，起始時間：2011/01-2013/12，資助金額：50萬元，已結(jié)題，主持。
(5) 國家自然科學(xué)基金面上項目，81071711，“再教育”腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞重建腫瘤免疫微環(huán)境-基于靶向調(diào)節(jié)Fra-1信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的免疫治療，起始時間：2011/01-2013/12，資助金額：32萬元，已結(jié)題，主持。
 
5. 課題組近5年代表性論文
(1) Chen C, Cao F, Bai L, 2, Liu Y, 2, Xie J, Wang W, Si Q, Yang J, Chang A, Liu D, Liu D, Chuang TH, Xiang R and Luo Y*, IKKβ enforces a LIN28B/TCF7L2 positive feedback loop that promotes cancer cell stemness and metastasis, Cancer Res, 2015, 75(8): 1725-1735
(2) Yang J, Zhang Z, Chen C, Liu Y, Si Q, Chuang TH, Li N, Gomez-Cabrerom A, Reisfeld RA, Xiang R*, Luo Y*, MicroRNA-19a-3p inhibits breast cancer progression and metastasis by inducing macrophage polarization through downregulated expression of Fra-1 proto-oncogene. Oncogene, 2014, 33(23): 3014-3023
(3) Yang J, Liao D, Chen C, Liu Y, Chuang TH, Xiang R, Markowitzb D, Reisfeld RA, Luo Y*, Tumor associated macrophages regulate murine breast cancer stem cells through a novel paracrine EGFR/Stat3/Sox-2 signaling pathway, Stem cells, 2013, 31(2): 248-258
 
6. 課題組近5年專利
(1) mir-100 抑制劑在降低癌癥轉(zhuǎn)移中的作用 Patent No. of China 201610601327.3 （中國發(fā)明專利）
 
五、葛微課題組
1. 課題組簡介
        葛微課題組構(gòu)建了完善的蛋白質(zhì)組學(xué)平臺，在蛋白水平上探究疾病發(fā)病過程中的蛋白表達(dá)譜變化。課題組主要研究興趣和方向：（1）結(jié)直腸癌的免疫應(yīng)答分子機制的研究；（2）基于人腦組織庫的蛋白質(zhì)組學(xué)研究。獲得了國家自然科學(xué)基金、諾和諾德、醫(yī)科院創(chuàng)新工程等項目的資助。2015-2017年，發(fā)表SCI論文32篇。目前課題組共培養(yǎng)5名博士生，3名碩士生，獲“北京市優(yōu)秀畢業(yè)生”稱號1次，國家獎學(xué)金3次。
 
2. 課題組負(fù)責(zé)人介紹
        葛微教授本科畢業(yè)于北京師范大學(xué)化學(xué)系，之后在河北農(nóng)業(yè)大學(xué)從事教學(xué)科研工作5年。2002年，獲得牛津大學(xué)全額獎學(xué)金資助攻讀有機化學(xué)博士，師從Professor Sir Jack. E. Baldwin，2005年在牛津大學(xué)取得博士學(xué)位，2005-2012年在牛津大學(xué)Professor Christopher J Schofield課題組做博士后研究。2013年回國后被聘為中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所免疫系教授，博士生導(dǎo)師，獲得協(xié)和學(xué)者稱號。
 
3. 課題組成員介紹
王霞，助理研究員，博士，郵箱：wangxia1507@gmail.com，電話：15117924226
方虓，實驗室管理員，郵箱：fangxkey@126.com，電話：13051168676
熊  峰  博士后
高延盼  博士生
占少華  博士生
羅  丹  博士生
張雨生  博士生
陳彥宇  碩士生
夏文超  碩士生
 
4. 課題組主要科研項目
（1）國家自然科學(xué)基金：DNA 甲基化調(diào)控的轉(zhuǎn)錄因子HSF4 在DC 細(xì)胞天然免疫應(yīng)答中的調(diào)控機制研究 。
（2）諾和諾德中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院聯(lián)合基金：測試對FTO的抑制是否能夠調(diào)節(jié)ghrelin（生長素）的表達(dá)和是否對治療糖尿病有用。
（3）中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程項目：炎癥與重大疾病的基礎(chǔ)與干預(yù)研究。
（4）中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程項目：神經(jīng)科學(xué)與重大神經(jīng)退行性疾病防治研究
（5）中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程項目：靈長類動物平臺
（6）中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與健康科技創(chuàng)新工程項目：五種自身免疫性疾病發(fā)病機制的研究
 
5. 課題組近5年代表性論文
（1）      Xu B, Zhao Y, Wang X, Gong P, Wei G. MZH29 is a novel potent inhibitor that overcomes drug resistance-FLT3 mutations in acute myeloid leukemia. Leukemia 2017 Apr, 31: 913-921.
（2）      Benhong Xu, Yanpan Gao, Shaohua Zhan, Feng Xiong, WenyingQiu, Xiaojing Qian, Tao Wang, Naili Wang, Di Zhang, Qian Yang, Renzhi Wang, XinjieBao, Wanchen Dou, Rui Tian, Shu Meng, WeipingGai, Yue Huang, Xiaoxin Yan, Wei Ge*, Chao Ma*. Quantitative protein profiling of hippocampus during human aging. Neurobiol Aging 2016 Mar, 39:46-56.
（3）      YanpanGao, Wei Ge*. Histone methyltransferase DOT1L inhibits osteoclastogenesis and protects against osteoporosis. Cell Death & Disease. 2017.
（4）      Shaohua Zhan, Tianxiao Wang, Wei Ge. Multiple functions of the E3 ubiquitin ligase CHIP in immunity. International Reviews of Immunology  2017 Jun 2:1-13.
（5）      Qingzhong He, Wei Ge. The tandem Agenet domain of fragile X mental retardation protein interacts with FUS. Scientific Reports, 2017 Apr, 7, 962.
（6）      Yanyu Chen, Yong Xie, Lai Xu, Shaohua Zhan, Yi Xiao, Yanpan Gao, Bin Wu, Wei Ge. Protein content and functional characteristics of serum-purified exosomes from patients with colorectal cancer revealed by quantitative proteomics. International Journal of Cancer. 2017 Feb 15;140(4):900-913
（7）      FuxingZuo, Feng Xiong, Xia Wang, Xueyuan Li, Renzhi Wang, Wei Ge, XinjieBao. Intrastriatal transplantation of human neural stem cells restores the impaired subventricular zone in Parkinsonian mice. Stem Cells. 2017 Jun;35(6):1519-1531.
（8）      YanpanGao, Yanyu Chen, Shaohua Zhan, Wenhao Zhang, Feng Xiong and Wei Ge. Comprehensive proteome analysis of lysosomes reveals the diverse function of macrophages in immune responses. Oncotarget, 2017 Jan, Vol. 8, (No. 5), pp: 7420-7440.
（9）      Lai Xu, Yanpan Gao, Yanyu Chen, Yi Xiao, Qingzhong He, HuizhongQiu, Wei Ge*. Quantitative proteomics reveals that distant recurrence-associated protein R-Ras and Transgelin predict post-surgical survival in patients with Stage III colorectal cancer. Oncotarget 2016 May, 7, 43868-43893.
（10）      Wei Ge, Dongxu Li, YanpanGao, Xuetao Cao. The Roles of Lysosomes in Inflammation and Autoimmune Diseases. Int Rev Immunol2015 Sep, 34(5):415-431.
 
6. 課題組近5年專利
        新型雙功能抗體偶聯(lián)物及其制法和用途，發(fā)明人：葛微，王有朝，何慶仲，丁航海。
 
六、程根宏課題組
1. 課題組簡介
        程根宏課題組以人體免疫功能在疾病發(fā)生和健康維護(hù)中的作用為突破口，從發(fā)現(xiàn)與疾病相關(guān)的核酸序列遺傳信息出發(fā)，建立多種實驗?zāi)Ｐ脱芯科鋵γ庖吖δ芎脱装Y反應(yīng)的影響，免疫功能和炎癥反應(yīng)異常與疾病發(fā)生、發(fā)展的相互關(guān)系；深入挖掘所編碼蛋白分子間相互作用的三維結(jié)構(gòu)信息，對疾病進(jìn)行預(yù)測、診斷、治療和預(yù)防；實現(xiàn)從基礎(chǔ)研究成果向臨床診斷、治療應(yīng)用的快速轉(zhuǎn)化。
        課題組建立以系統(tǒng)免疫、生物信息、結(jié)構(gòu)功能及檢測治療為核心的四大平臺和系統(tǒng)醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究為支撐的體系，建立針對感染性疾病、惡性腫瘤、炎癥與自身免疫疾病、代謝性疾病、老年退行性疾病的系統(tǒng)醫(yī)學(xué)臨床研究部。利用高通量組學(xué)技術(shù)獲取不同疾病個體各項功能組學(xué)數(shù)據(jù)，通過生物信息學(xué)和計算生物學(xué)方法對海量數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析，探索疾病發(fā)生、發(fā)展機制，闡明誘導(dǎo)疾病發(fā)生的環(huán)境因素和遺傳因子，尋找預(yù)測個體對疾病及藥物易感性的新途徑，建立對復(fù)雜疾病更為有效的預(yù)測、診斷和治療的個性化方案。
 
2. 課題組負(fù)責(zé)人介紹
        程根宏教授，理學(xué)博士，現(xiàn)任中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所系統(tǒng)醫(yī)學(xué)研究中心主任。程根宏教授1984年畢業(yè)于武漢大學(xué)獲學(xué)士學(xué)位，1990年在美國紐約Albert Einstein醫(yī)學(xué)院分子生物學(xué)專業(yè)獲得博士學(xué)位，后曾分別在美國洛克菲洛大學(xué)和麻省理工學(xué)院做博士后研究，導(dǎo)師為諾貝爾獎獲得者David Baltimore。從1996年開始至今，在美國洛杉磯加州大學(xué)的微生物學(xué)和分子遺傳學(xué)系從事感染、免疫、癌癥和代謝等多學(xué)科的研究。美國加州大學(xué)洛杉磯分校（UCLA）微生物與免疫遺傳學(xué)系正教授，中科院生物物理所兼職教授,第二軍醫(yī)大學(xué)講座教授，吉林大學(xué)訪問教授。
        2006年獲中科院百人計劃獎，2008年獲國家海外杰出青年獎。曾先后獲得包括美國白血病與淋巴癌學(xué)會頒發(fā)的斯托爾曼獎等多項科學(xué)成就獎，2012年被選為美國科學(xué)促進(jìn)會(AAAS)會士。榮獲并領(lǐng)導(dǎo)美國國立衛(wèi)生研究院（NIH）等多個研究機構(gòu)的20多項研究基金，在國際著名雜志發(fā)表論文140篇，其中大篇分別發(fā)表在學(xué)術(shù)地位最高級的《Nature》和《Science》等雜志。歷任美國衛(wèi)生院科研基金評審委員和國際著名的30種雜志的評審。
 
3. 課題組成員介紹
都培雙：課題組特聘教授；學(xué)歷：博士； Email：psdu@ibp.ac.cn；電話：010-65105157
魯 寧：課題組特聘教授；學(xué)歷：博士；Email：ningscience@yahoo.com；電話：010-65105157
郭 蓉：課題組科研助理；學(xué)歷：碩士；Email：guorong329@126.com；電話：010-65105157
 
4. 課題組主要科研項目
1)      程根宏引進(jìn)人才特別資助經(jīng)費項目：2013年1 月至  2014年12月；
2)      衛(wèi)生行業(yè)專項項目（健康人群與重大疾病狀態(tài)免疫功能數(shù)據(jù)庫建立及其在疾病早期診斷和治療評估中的應(yīng)用）：2013年6月至2016年6月；
3)      中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費項目（重大疾病的系統(tǒng)生物學(xué)研究）：2014年10月至2015年12月；
4)      國家科技重大專項（抗埃博拉病毒應(yīng)急藥物的研發(fā)）：2015年1月至2018年12月；
5)      程根宏引進(jìn)人才特別資助經(jīng)費項目：2015年1月至2016年12月；
6)      中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費項目（重大免疫相關(guān)性疾病的系統(tǒng)生物學(xué)研究）：2016年11月至2017年11月；
7)      中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院創(chuàng)新工程項目。
 
5. 課題組近5年代表性論文
1)      Lulan Wang, Stephanie G. Valderramos, Aiping Wu, Songying Ouyang, Chunfeng Li, Patricia Brasil, Myrna Bonaldo, Thomas Coates, Karin Nielsen-Saines, Taijiao Jiang,  RoghiyhAliyari, and Genhong Cheng. From Mosquitos to Humans: Genetic Evolution of Zika Virus. Cell Host Microbe 19:561-565. Volume 19, Issue 5, 11 May 2016, Pages 561–565.
2)      Z.Wang, J.Ji,D.Peng, F.Ma, G.Cheng, and F.X.Qin.  Complex Regulation Pattern of IRF3 Activation Revealed by a Novel Dimerization Reporter System.  J Immunol. 2016 May 15;196(10):4322-30.
3)      Shanshan Wang, Yongzhi  Chen, Chunfeng  Li, Yaoxing  Wu, Lei  Guo, Changwei  Peng, Yueping Huang, Genhong  Cheng and F. Xiao-Feng Qin. TRIM14 inhibits hepatitis C virus infection by SPRY domain-dependent targeted degradation of the viral NS5A protein. Scientific Reports. Sci Rep. 2016; 6: 32336.
4)      Lidong Wang , Xinxin Ci , HongmingLv, Xiaosong Wang, F Xiaofeng Qin and Genhong Cheng. Isotetrandrine ameliorates tert-butyl hydroperoxide-induced oxidative stress through upregulation of heme oxygenase-1 expression. Experimental Biology and Medicine. May 2, 2016.
5)      Lulan Wang, Aiping Wu, Yao E. Wang, Natalie Quanquin, Chunfeng Li, JingfengWang,Hsiang-Wen Chen, Suyang Liu, Ping Liu, Hong Zhang,F. Xiao-Feng Qin, TaijiaoJiang,Genhong Cheng. Functional Genomics Reveals Linkers Critical for Influenza Virus Polymerase. Journal of Virology. J Virol ，March 2016， 90:2938-47.
6)      Chang, S., Sun, D., Liang, H., Wang, J., Li, J., Guo, L., Wang, X., Guan, C., Boruah, B.M., Yuan, L., ,G. Cheng,W. Wang, and Y.F. Liu. Cryo-EM structure of influenza virus RNA polymerase complex at 4.3 A resolution. Mol Cell.2015
7)      Deng, L., M. Liu, S. Hua, Y. Peng, A. Wu, F. X. Qin, G. Cheng, and T. Jiang.  Network of co-mutations in Ebola virus genome predicts the disease lethality. Cell Res 2015,25:753-756.
8)      Wang, L., A. Wu, Y. E. Wang, N. Quanquin, C. Li, J. Wang, H. W. Chen, S. Liu, P. Liu, H. Zhang, F. X. Qin, T. Jiang, and G. Cheng.  Functional Genomics Reveals Linkers Critical for Influenza Virus Polymerase. J Virol 2015,90:2938-2947.
9)      Qin, F. X., C. Y. Jiang, T. Jiang, and G. Cheng.  New targets for controlling Ebola virus disease. Natl Sci Rev 2015,2:266-267.
10)      Li, C., Wu, A., Peng, Y., Wang, J., Guo, Y., Chen, Z., Zhang, H., Wang, Y., Dong, J., Wang, F. X. Qin, G. Cheng, T.Deng and T. Jiang. Integrating computational modeling andfunctional assays to decipher thestructure-function relationship ofinfluenza virus PB1 protein. Sci Rep 2014,4, 7192.
11)      L. Zhao, T. Hua, C. Crowley, H. Ru, X. Ni, N. Shaw, L. Jiao, W. Ding, L. Qu, L. W. Hung, W. Huang, L. Liu, K. Ye, S. Ouyang, G. Cheng and Z. J. Liu. Structural analysis of asparaginyl endopeptidase reveals the activation mechanism and a reversible intermediate maturation stage. Cell Res. 2014,24:344-58
 
6. 課題組近5年專利
1)      專利名稱：包含25-羥基膽固醇的制劑及其制備方法和抗病毒的應(yīng)用；申請?zhí)枺?01410441317.9
2)      專利名稱：一種用于篩選流感病毒聚合酶組裝抑制劑的細(xì)胞系及其構(gòu)建方法 ；申請?zhí)枺?01511008822.5
3)      專利名稱：CECAM1蛋白作為血清標(biāo)記物在診斷肝臟疾病中的用途；申請?zhí)枺?01610292633.3
4)      專利名稱：包含AFP、GP73、CEACAM1的血清標(biāo)記物在診斷肝臟疾病中的用途；申請?zhí)枺?01610292960.9
5)      專利名稱：GP73蛋白作為血清標(biāo)記物在診斷癌癥中的用途；申請?zhí)枺?01610292620.6