制藥工程是一級學科化學工程（530）下設(shè)置制藥工程（530.64）二級學科（學科分類與代碼GB/T 13745-2009/XG2-2016），為化學、生物學、藥學（中藥學）和工程學交叉的工科類專業(yè)，以培養(yǎng)從事藥品研發(fā)制造，新工藝、新設(shè)備、新品種的開發(fā)、放大和設(shè)計人才為目標。緊密圍繞以全面提升人才培養(yǎng)質(zhì)量和科技創(chuàng)新能力為根本目標，以服務區(qū)域經(jīng)濟社會發(fā)展為已任，加強科學研究與人才培養(yǎng)，初步形成了一定的辦學特色與優(yōu)勢。本專業(yè)為校級品牌專業(yè)建設(shè)點，擁有“淮安市特色資源藥用開發(fā)與利用重點實驗室”、“江蘇省特色資源開發(fā)與藥用研究重點實驗室”等省市級科研平臺，為適應江蘇特色藥用植物、藥用水（海）產(chǎn)、蘇北鹽化工及凹土等特色資源產(chǎn)業(yè)開發(fā)需求,進行特色資源開發(fā)與藥用研究，圍繞區(qū)域特色生物新醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)等新興戰(zhàn)略產(chǎn)業(yè)，凝練學科研究方向，匯聚創(chuàng)新資源，已形成了區(qū)域特色中藥資源開發(fā)及藥效物質(zhì)生物轉(zhuǎn)化、凹土基藥用功能材料、巖鹽資源藥用開發(fā)及藥物中間體制備、藥用殼聚糖及復合材料等四個研究方向。近年來，本專業(yè)及相關(guān)專業(yè)獲得1項國家科技發(fā)明二等獎等多項省部級以上獎勵，獲批多項國家自然科學基金，科研經(jīng)費到款達2000萬以上。