北京大學工學院生物醫(yī)學工程系成立于2005年。作為新的工學院的組成部分，生醫(yī)系從建系之初就致力于在工程科學的范疇內(nèi)進行生命科學和醫(yī)學的前沿研究，迅速地建立了研究生教育教學體系，并在生物醫(yī)學工程研究方面取得了重要的進展。目前，已開展的重點研究方向包括：(1) 面向重大疾病的納米醫(yī)學; (2) 生物材料與再生醫(yī)學;(3) 生物力學和生物信息學; (4) 分子醫(yī)學影像學;(5)微創(chuàng)醫(yī)學; (6)神經(jīng)醫(yī)學工程; (7) 移動/遠程醫(yī)學與健康信息學。建系以來，生醫(yī)系已具有雄厚的科研實力，先后承擔了國家重點基礎研究發(fā)展計劃(973)、國家高技術研究發(fā)展計劃(863)、國家自然科學基金、國際合作項目等一大批科研項目，科研總量逐年增長。

目前，生醫(yī)系已擁有一支朝氣蓬勃的中青年科研隊伍，其中教授4人，副教授4人，特聘研究員6人，全部具有海外留學經(jīng)歷。他們活躍在生物醫(yī)學工程科研與教學的第一線，緊密跟蹤國際學術前沿，開展生物醫(yī)學工程高端領域的科研工作。

建系以來，生物醫(yī)學工程系與美國佐治亞理工大學、約翰霍普金斯大學、麻省理工學院、哈佛大學等國際著名院校建立了良好的教學和科研合作關系。其中，生醫(yī)系與美國佐治亞理工大學、埃默里大學進行廣泛的合作，在Coulter種子基金的支持下進行了生物醫(yī)學工程領域內(nèi)不同研究方向的合作，并建立了全國首個由國務院學位辦正式審批通過的聯(lián)合博士學位項目，目前已招收兩屆來自中美兩地共30名博士生。

自2010年起，生物醫(yī)學工程系正式招收本科生，并啟動了本科生教學培養(yǎng)的一系列工作。本專業(yè)注重“強化基礎、重視素質(zhì)、追求創(chuàng)新”，致力于培養(yǎng)具有扎實的理論基礎和專業(yè)知識、良好的綜合能力和創(chuàng)新意識的生物醫(yī)學工程領域的高素質(zhì)、引領性的復合型人才。

生醫(yī)系還針對不同學科背景研究生深入開展碩士生、博士生培養(yǎng)，主要開設課程包括生物醫(yī)學工程概論、生物醫(yī)學工程的數(shù)學基礎、生物醫(yī)學工程的生物學基礎、生物傳感器和生物醫(yī)學儀器、生物醫(yī)學系統(tǒng)的建模和仿真、生物醫(yī)學材料、納米/微米和單分子技術、生物力學（固體、流體和細胞力學）、激光醫(yī)學、磁共振原理和序列設計基礎等。

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