生態(tài)學科于2001年經(jīng)教育部批準設置生態(tài)學本科專業(yè)并招生，同年獲得生態(tài)學專業(yè)碩士學位授予權；2003年獲得生態(tài)學專業(yè)博士學位授予權，同年生態(tài)學科被批準為安徽省重點學科；2011年獲得生態(tài)學一級學科博士學位授予權。本學科在揚子鱷保護研究領域具有很高的國際關注度。研究成果多次在中央電視臺科學頻道報道。

本學科師資力量強，專任教師中，教授11名、副教授12名、講師5名。專任教師全部具有博士學位，其中1人獲國外博士學位，7人有海外留學經(jīng)歷。擁有講席教授1名、安徽省學術和技術帶頭人（1人）及后備人選（2人）共3名。綜合素質(zhì)良好的師資隊伍為人才培養(yǎng)奠定了基礎條件。
本學科博士學位授權點下設種群與群落生態(tài)學、保育生態(tài)學、進化生態(tài)學、污染生態(tài)學等4個研究方向。在輪蟲種群生態(tài)學及進化生態(tài)學、瀕危動物的遺傳多樣性與系統(tǒng)進化關系、魚類群落生態(tài)學及漁業(yè)資源保護和利用、水生態(tài)毒理學及水環(huán)境監(jiān)測、污染土壤的生態(tài)修復與治理以及昆蟲群落生態(tài)學等研究領域具有明顯優(yōu)勢。
生態(tài)學作為安徽省重點學科，擁有安徽省重要生物資源保護與利用研究重點實驗室、安徽省高校生物環(huán)境與生態(tài)安全重點實驗室，擁有安徽省生物標本資源數(shù)字化公共服務平臺、皖江城市帶退化生態(tài)系統(tǒng)的恢復與重建省級協(xié)同創(chuàng)新中心、安徽師范大學—中國科學院東湖生態(tài)站大學生校外實踐教育基地。
十二五期間，2個一級學科共主持各類科研項目90余項，累計科研經(jīng)費2600余萬元（不包括各種平臺建設經(jīng)費）；發(fā)表SCI(E)收錄論文200余篇；獲安徽省自然科學獎二等獎、三等獎各1項；1人獲得“全國優(yōu)秀科技工作者”稱號；1人獲得“全國模范教師”，1人獲安徽青年科技獎。1篇生態(tài)學博士學位論文獲安徽省優(yōu)秀博士學位論文，是迄今為止安徽省唯一一篇生態(tài)學科的省級優(yōu)博論文。高質(zhì)量的研究工作，擴大了學科的學術影響，提升了服務能力，為社會做出了重要貢獻。