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學科建設

截至2018年5月，學校擁有山東省重點學科2個。
山東省重點學科：應用化學、理論物理
 

師資力量

截至2018年5月，學校共有教職工1564人，專任教師1090人，具有碩士、博士學位的專任教師736人，具有高級職稱的專任教師377人。教師中有全國優(yōu)秀科技工作者1人、享受國務院政府特殊津貼的專家1人、教育部大學生物學課程教學指導委員會委員1人，山東省有突出貢獻的中青年專家3人、山東省高校重點學科首席專家2人、山東省本科教育教學指導委員會委員1人，山東省高校教學名師10人、山東省優(yōu)秀教學團隊3個，“海智專家”31名。
類別 姓名（團隊名稱）
國務院特殊津貼專家 李洪奇
山東省有突出貢獻的中青年專家 徐興磊、李傳安等
山東省高校重點學科首席專家 李洪奇、田智祥
山東省教學名師 張素云、劉傳進、朱道玉、王宜磊、趙玉英、李洪奇、徐興磊等
山東省優(yōu)秀教學團隊 物理學專業(yè)主干課程教學團隊（2008年，李洪奇）
基礎化學系列課程教學團隊（2011年，林憲杰）
公共教育學教學團隊（2012年，趙玉英）
 

教學建設

截至2018年5月，學校擁有山東省人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)1個、山東省實驗教學示范中心1個、山東省高水平應用型專業(yè)群5個、山東省特色專業(yè)6個、山東省卓越工程師計劃專業(yè)2個、山東省專業(yè)綜合改革試點項目1個，山東省精品課程22門、山東省雙語教學示范課程1門。 [1]
項目類別 項目名稱
山東省人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū) 菏澤學院教師教育專業(yè)人才培養(yǎng)創(chuàng)新實驗區(qū)
山東省實驗教學示范中心 機電工程實驗教學中心
山東省高水平應用型專業(yè)群
機械電子工程專業(yè)群、小學教育專業(yè)群、化工專業(yè)群、生物工程群等
山東省特色專業(yè) 生物教育、心理咨詢、物理學、財務管理、化學工程與工藝、生物科學
山東省卓越工程師計劃專業(yè) 機械電子工程、食品科學與工程
山東省專業(yè)綜合改革試點項目 財務管理
山東省精品課程
文學概論、寫作、思想道德修養(yǎng)與法律基礎、微生物學、人體組織解剖學、
數字電子技術、排球、電路分析基礎、高頻電子線路、模擬電子技術、C語言、
軟件工程、數據結構、金工實訓、電工實訓、數控實訓、汽車實訓、傳感器原理
及應用、微機原理與接口技術、DSP原理與應用、數字信號處理、信號與系統(tǒng)
山東省雙語教學示范課程 植物生理學

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